集团公司机关设 15个部门：党委工作部、纪委、工会、办公室、企管部、财务部、审计部、人事部、客运经营部、安全机务部、基建房管部、武装保卫部、离退休人员管理中心、客运结算管理中心、安全统筹办公室。


    集团公司下设 21个客运单位：南阳汽车站、高客分公司、快客分公司、一分公司、二分公司、三分公司、五分公司、六分公司、旅游分公司、安达出租车分公司、镇平分公司、内乡分公司、西峡分公司、淅川分公司、邓州分公司、新野分公司、唐河分公司、桐柏分公司、社旗分公司、方城分公司、南召分公司。


    集团公司下设 8个子公司：金方正塑胶有限公司、石油公司、亚飞汽车销售公司、教育培训中心、商贸公司、货运公司、汽车修理公司、物业公司。